يُعتبر المركز تطوراً طبيعياً لشعبة الدعوة بالمركز الإسلامي سابقاً وإدارة الدعوة في ظلّ جامعة أفريقيا العالمية، ليواكب توسُّع المؤسسة نفسها، إذ آلت إليه مهام أكبر، وهذا ما دعا إلى التطوُّر الهيكلي بزيادة وظائف وأنشطة جديدة.

أولاً: قسم الدعوة وتتمثَّل أنشطته في:

(1)  نشاط المسجد: وذلك عبر:

‌أ-  جعل المسجد محور حركة المجتمع الجامعي وساحة العلم.

‌ب-  توثيق الأواصر بين كيانات الطلاب من جمعيات وروابط عبر حلقات الدروس والمحاضرات بالمسجد.

(2)  رعاية المهتدين:

وذلك عبر نشر الإسلام ورعاية حديثي العهد به بدعمهم وتأهيلهم دعوياً، روحياً ومهنياً بتنظيم دورات متخصصة لهم.

(3)  القوافل والمخيمات الدعوية: ومن أهمّ أهدافها:

‌أ-  نشر الدعوة عبر برنامج مطلوبات الجامعة الدعوية.

‌ب-  تعميق التديُّن في المجتمع من خلال الدورات القصيرة والطويلة التي تُنظَّم أثناء القوافل والمخيمات.

(4)  النشر والإعلام الدعوي: ويضطلع بـ:

‌أ- المساهمة في نشر البحوث والدراسات العلمية في مجال الدعوة من خلال مجلة "دراسات دعوية" (علميَّة مُحكَّمة تصدر مرتين خلال العام).

‌ب-   ترجمة الدراسات والبحوث الإسلامية إلى اللغات الأفريقية.

‌ج-       التوثيق والأرشفة لأنشطة أقسام المركز المختلفة من خلال نشرة شهرية وتنظيم المعارض السنوية.

ثانياً: قسم النَّشاط والعلاقات ويهتم بالآتي:

‌أ-  رعاية الروابط الطلابية وترقية أنشطتها الثقافية والفكرية والإدارية.

‌ب-  تنمية العلاقات مع الجمعيات والمؤسسات الدعوية داخل وخارج السودان.

‌ج-   تنمية علاقات الجامعة مع خريجها داخل وخارج السودان.

ثالثاً: قسم تنمية المجتمع وتتمثَّل أنشطته في الآتي:

(1) برنامج الدبلومات الوسيطة :ومن أهدافه :

‌أ- تزويد الدَّارسين(طلاب وطالبات) بحصيلة متنوعة في بعض مجالات المعرفة وربط ذلك بمفاهيم الإسلام وتنمية القيم والاتجاهات الإسلامية في نفوسهم.

‌ب-  وضع المناهج الدراسية في التخصصات:

1. علوم القرآن

2. الدعوة والدراسات الإسلامية

3. الإدارة والعلوم المالية

4. الاقتصاد والعلوم السياسية

5. الإعلام

‌ج-    توسيع برامج الدبلومات ونشره خارج الجامعة.

(2) نشاط المراكز الدعوية الخارجية: ومن أهدافه:

‌أ-  تنمية المجتمع وتعميق روح التدين بين أفراده بتأسيس مشروعات دعوية وثقافية.

‌ب-  إعداد القيادات والدُّعاة وإحداث تأثير في المناطق المختلفة وربطها بأهداف الجامعة.

(3) شعبة الدورات:

                                  1.         دورتين لضباط الصف والجنود

                                  2.         دورتين للقيادات الأهلية ومدتهما شهر واحد

                                  3.         دورة القيادات العليا (قوات مسلحة والشرطة) ومدّتها شهر واحد

رابعاً: شبكة معلومات أفريقيا وتتبَع لمُدير المركز، ومن أهدافها:

(1) توفير المعلومات اللازمة عن أفريقيا لأغراض علمية وتأسيس قاعدة تنظِّم المعلومات عن أفريقيا.

(2) إنشاء قاعدة تدريب في مجالات الحاسوب واللغات والإنترنت.

(3) توثيق الصلات مع الجهات المختلفة المهتمة بشئون المسلمين في أفريقيا.

ويحتوي نشاط الشبكة على:

‌أ- برنامج المعلومات:

I-  ويُعنى بالمعلومات من حيث توفيرها، حفظها، تحليلها واستخراجها.

II-   إصدار مجلة "رسالة أفريقيا" الشهرية: وهي مجلة معلومات متخصصة عن أفريقيا.

‌ب-   برنامج التدريب:

والذي من خلاله تقوم الشبكة بتدريب الدَّارسين على استخدام الحاسوب من طلاب وطالبات الدبلومات الوسيطة وغيرهم من داخل وخارج الجامعة.

‌ج-    تنظيم دورات في اللغات الأفريقية.

خامساً: المكاتب المساعدة

        1.         مكتب المسجل

وهو المسئول عن إدارة العمل الأكاديمي والتجويد الإداري من حيث القبول والتسجيل والامتحانات والشَّهادات.

        2.         مكتب الشئون المالية والإدارية

ويقتصر دوره على توفير المُعينات اللازمة للعمل وتهيئة وترقية بيئة العمل ومراقبة العمل الحسابي والمالي.

        3.         المكتب التنفيذي             

وهو المسئول عن تنسيق العمل بين أقسام المركز المختلفة وإعداد الخطط، الميزانية، التقارير الشهرية بالإضافة إلى اضطلاعه بمهمة تأهيل العاملين بالمركز وتطوير نظم العلاقات العامة لتواكب تطور المركز.